En étudiant le génome d’un agent pathogène, les chercheurs sont capables d’extraire des informations importantes sur l’origine et l’évolution d’un virus, informations qui peuvent avoir un impact direct sur les stratégies de lutte contre la maladie.

Souvent, le meilleur moyen d’atténuer ou de prévenir la diffusion d’un virus est de comprendre son origine. Pour cela, les scientifiques s’appuient sur le génome de l’agent pathogène.

«L’extraction d’informations évolutives et épidémiologiques à partir des génomes des agents pathogènes est devenue un outil important dans la recherche sur les maladies», explique Philippe Lemey, chercheur en virologie évolutive et computationnelle à la KU Leuven. «En exploitant ces informations, les épidémiologistes moléculaires peuvent apporter un nouvel éclairage sur les origines et l’histoire épidémique d’un agent pathogène, notamment sur sa provenance et sur la manière dont il s’est adapté à de nouveaux hôtes et s’est propagé.»

Avec le soutien du projet ReservoirDOCs, financé par l’UE, Philippe Lemey dirige un effort visant à utiliser ces informations génomiques pour comprendre à la fois l’origine de certains virus et la manière dont ils se sont établis dans les populations humaines.

«Nous avons également entrepris de développer de nouvelles méthodes informatiques pour analyser ces données génomiques, en mettant l’accent sur l’intégration avec d’autres données», ajoute Philippe Lemey…

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