Les scientifiques ont découvert une nouvelle méthode pour analyser comment des agents actifs affectent une protéine spécifique essentielle à la survie des cellules. Leur recherche permettrait de développer rapidement des médicaments ayant moins d’effets secondaires.
L’efficacité de nombreux médicaments repose sur la manière dont ils manipulent le métabolisme des cellules en empêchant certaines protéines spécifiques d’agir. Toutefois, les analyses de l’effet d’un agent actif sur la structure de sa protéine cible ont jusqu’à présent souvent recouru à des procédures chronophages qui nécessitent beaucoup de matériaux.
Une équipe de chercheurs soutenue par le projet K4DD, financé par l’UE, a introduit une façon alternative d’examiner ces interactions à l’aide d’un capteur infrarouge. L’étude a récemment été publiée dans la revue «Angewandte Chemie».
Cette nouvelle méthode fournit des informations sur les changements structurels qui surviennent en quelques minutes dans les protéines cibles et peut aider à réduire le type de changement structurel, comme l’explique l’Université de la Ruhr à Bochum (RUB) dans un communiqué de presse. «Le capteur repose sur un cristal perméable à la lumière infrarouge. La protéine est liée à sa surface. Les spectres infrarouges qui traversent le cristal sont enregistrés, tandis que la surface est rincée avec des solutions dotées ou dépourvues d’agents actifs.»
La protéine de choc thermique
Dans l’article de la revue, les chercheurs ont déclaré que l’étude des «interactions protéine-ligand est essentielle au début des processus de découverte de médicaments». Afin de démontrer la fiabilité de leur méthode, ils ont immobilisé la protéine de choc thermique HSP90 sur un cristal à réflectance totale atténuée. «Cette protéine est une cible moléculaire importante pour les médicaments qui luttent contre plusieurs maladies, dont le cancer. Notre nouvelle approche nous a permis d’examiner un changement structurel secondaire induit par un ligand.» L’équipe a analysé deux modes de liaison spécifiques de 19 composés proches des médicaments. «Des modes de liaison différents peuvent entraîner une différence en termes d’efficacité et de spécificité chez différents médicaments.»
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